Représentative à la fois de la diversité technique et des plus grands noms de la gravure, la collection d'Estampes s'étend du 15e siècle à nos jours.
La collection d’estampes contient environ 2.500 pièces couvrant toute l’histoire de cet art, du 15e siècle à nos jours. Le Fonds principal de la collection est le Fonds Suzanne Lenoir (près de 1.500 estampes) donné par le collectionneur Eugène Rouir au Musée en 1994.
Elle comprend des séries d’œuvres d’artistes renommés, tels que Albrecht Dürer, Rembrandt, Canaletto, Jean-Baptiste Camille Corot, Edouard Manet, James Ensor, Juan Miro ou encore, Pablo Picasso. Cette collection est présentée par roulement, via des accrochages thématiques.